Khi Zion - thành trì cuối cùng của nhân loại, chỉ còn vài giờ nữa sẽ sụp đổ, Neo và Trinity, hai anh hùng dũng cảm, đã dũng cảm quay trở lại Ma Trận, nơi ẩn chứa những bí mật đen tối nhất của máy móc. Hy vọng le lói trong trái tim họ, Neo và Trinity quyết tâm giải phóng nhân loại khỏi sự giam cầm của Ma Trận và đưa loài người trở về với ánh sáng tự do.